怎么用NCBI查叶绿体基因
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/06/05 14:27:19
NCBI没有这样的数据,你可以在CodonUsageDatabase查到相关物种的密码子偏好信息.CodonUsageDatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自NCBI,也是学术界和工
搜到的序列有些是包含基因所在的染色体片段的,所以很长;有些是该基因的全长序列,包括基因的编码区和非编码区;cds的就是基因的编码区序列.主要看你的目的来选择的.
进入NCBI主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在第一个下拉菜单Search那一栏中选上gene然后在搜索框中填上基因的名称,还可以加上种属名,如人是Homosapiens以上
你在NCBI主页上找一个BLAST.这是一个序列比对在线工具,自己摸索使用啦.基本的序列比对功能一定可以满足的.
首先打开NCBI网站首页,然后在search一栏中选择nucleotide,在框中输入你要的基因序列名称,点击search就行.然后会出来很多结果,因为很多基因是同名的,或是一个基因在不同种属中不一样
除非你的猪的品种很特别,一般查已知的克隆出来的猪的基因就行了,很保守的出现突变或差异的概率很小,如果是扩这段基因的话直接找一个就行,没多大差异,克隆出来了再去测序就知道不同品种间的差异了.
www.pubmed.gov搜索框的下拉菜单选Nucleotide,框中输入基因名,点击Search,或按Enter键.
NCBI上一般不会有说明,你需要近其他预测信号肽的网站进行分析比如:
NCBI功能详介和使用方法
看看下面的资料,
1,如果你知道基因名称的话,进入NCBI主页,在选项后面选择GENE然后输入你要查找的基因名称.2,如果你知道基因序列的编号,选择NECLEOTID然后输入你的序列ID即可3如果你知道有关基因的部分信
查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO
1打开NCBI主页2左边search里面选择GENE右边的对话框里输入你想要的基因名称3在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homosapiens是人Feliscatus是猫.选择你想要的种属
可以试试blast程序,在主页的右上方
cry1ab/cry1ac
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
一般而言,在NCBI(也就是Entrez数据系统)查基因序列,主要是搜索的NCBI的Genbank数据库的核酸与蛋白质序列,方法见六零六406.由于Genbank起初是一个类似BBS的序列数据库系统,
登陆ncbi主页,选择Gene数据库(不建议选All database),在搜索栏中输入“Sus scrofa domesticus mitochondrion
在前面的框里选gene,后面输入金黄色葡萄球菌的英文名和glucan,然后go,就可以了
在NCBI中需要选核算那个选项,然后写出微生物英文缩写名称,另外最好写上该基因片段名称.点击搜索即可.会搜到很多基因,找几个典型的基因,然后复制到txt文档里,用DNAStar的editseq来查询已