百度作业网DNAMAN怎样获得内含子序列
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/04/29 17:23:28
可以插入内含子.某些内含子有增强子/减弱子的功能；可以改变mRNA的结构从而改变mRNA稳定性；可以表达小RNA从而改变翻译表达水平.
内含子是基因内的间隔序列,不出现在成熟的RNA分子中,在转录后通过加工被切除.大多数真核生物的基因都有内含子.内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域.
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置
只有mrna的情况下不借助基因库事找不到的
用primer5就可以
为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementaryDNA之缩写,或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链.与RNA链互补的单链DNA,以其RNA为模板,
基因是个功能序列.内含子是基因序列,虽然不编码蛋白,但是在MRNA编辑,剪切以及基因调控上起作用,是功能上不可缺少的.DNA的非基因碱基序列,是指一些中度重复,高度重复序列,还有卫星DNA等.还包括转
大多数真核生物的基因都有内含子.需注意的是,在古细菌中也有内含子.在转录后的加工中,从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列.术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域.大多数真核结构基因中的间
不会导致该基因功能丧失.只要该基因时所有的外显子都得到了表达,那么翻译出来的蛋白就是一个完整功能的蛋白.内含子重复序列的缺失可能会导致该基因存在于整个基因组上时的功能,比如空间折叠,转录等等.个人意见
基因的全序列是么?OK进入NCBI,选中mapview选择项.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/输入你要下载的基因名称和物种.举个例子,我要下载小鼠的IGF2基因
不一定要用dnaman呀,到ncbi上面sequenceanalysis的orffinder就可以了,dnastart等一堆工具也可以用的.
Aninterruptedgene(alsocalledasplitgene)isagenethatcontainssectionsofDNAcalledexons,whichareexpressed
GT-AG规则存在着一定的变异.近缘基因组中的同源基因一般有保守的intron/exon结构,可以帮助鉴定内含子和外显子的边界.
如果你已知一些基因的序列,可以用DNAMAN比对,如果不知道,就要从NCBI上查.
使用blastn里面的 “Align two or more sequences”,出现两个输入序列的窗口,分别输入基因组序列和mRNA序列,mRNA
ncbiblast中的protein
真核生物DNA上的基因在转录时会将外显子和内含子一并转录为mRNA,只是此时的mRNA还是不成熟的mRNA,在翻译成蛋白质之前,它还要进行剪切和修饰,剪切就是将非编码的内含子转录片段剪去,修饰包括加帽
如果设计在内含子序列中,RT-PCR检测到的可能是未被剪切的preRNA或RNA中污染的核DNA,如果设计在外显子序列中,RT-PCR检测到的可能是成熟mRNA,未被剪切的preRNA或RNA中污染的