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求助蛋白质晶体结构模拟

来源:学生作业帮 编辑:百度作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/04/19 01:16:18
求助蛋白质晶体结构模拟
p2x4是广泛物种分布的蛋白质,现在已经解析出斑马鱼zfP2X4的晶体结构(可在数据库中下到),我想通过zfP2X4的结构模拟出大鼠rP2X4的结构应该怎么做?谁能指导下?答得好的有加分
求助蛋白质晶体结构模拟
首先要搞清楚你模拟的原因是什么,有什么意义,如果斑马鱼和鼠的蛋白序列基本相同,你何须模拟,基本可以拿来就用,如果差异很大,你可以采用分段模拟,相同的部分采用已经有的数据,不同的地方直接利用Swissprot的同源建模程序,或者你干脆就利用其程序帮你模拟,然后再对比
再问: 你是比较专业的吗, 我不懂那些程序,你再具体指导下吧或者帮帮我,我就是需要模拟rat的一部分结构就可以了
再答: 你根本不需要理解那些程序,你只要提交你的序列,他们会给你答案到你的邮箱的
再问: 你可以帮个忙搞下吗?我把需要的序列给你,你收到邮件后转发给我,我给100分可以吗?
再答: 我不专门做这个,只是偶尔涉及到,我对结构生物学不是很感冒,不知道你非要模拟有什么用,但是你可以进入Swisprot网站,按照要求提交你的序列,很快就会弄好,我觉的模拟没啥用处,所以自己只试过几次,后来就很少登那个网站了