如何知道一条蛋白质序列在PBD数据库中有没有3D结构?

来源：学生作业帮编辑：百度作业网作业帮分类：综合作业时间：2024/04/30 20:43:20

如何知道一条蛋白质序列在PBD数据库中有没有3D结构?
不好意思，是PDB数据库

1.在NCBI或者BLAST中找到这段序列所在蛋白质的名称,以及其它所有用过的名字或者别名
2.在PDB中搜索这些名字或名称,看有没有存在的结晶结构,大多数是NMR的或者X-ray的.
3.不放心的话,可以在string啦,或者其他的数据库中找相关的链接,看看有没有PDB的相关标号,就是4位由数字和字母混合成的晶体结构标号.
4.几方面一综合,就知道有没有了.不过如果不是关键蛋白质的话不要抱太大的希望,结晶难度很大,所以存在的晶体结构不是很多的,没有晶体结构的3D结构都是预测或者推测的,不作数.
以上
再问：谢谢。我已经知道了，主要是用BlastP然后选PDB的那个，最后出现的比对结果，如果是红的证明相似度较高，也就是说在PDB数据库中就差不多有了。

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