引物设计是单个外显子还是多个外显子
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/12 18:51:18
你的realtimePCR扩增的是cDNA啊,因此用CDS序列啊.
用PP5.0或oligo软件.网上有很多说明书的,操作十分简单再问:等于白说
你的pcr产物不就是你的目的EST序列咩?你设计的引物就是为了把目的EST序列扩增出来啊
就问题本身而言,引物合成回来是固体粉末,你把它溶于水中,再做一步变性退火就行了(不过由于是hairpin,形成二聚体的可能性也很大,这个似乎不可避免).另外我不太明白为什么要用hairpin的引物?在
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
DNA或RNA都行.在体内DNA复制的时候引物为RNA.
cDNA再问:真核基因转染其他细胞时一般选择表达DNA还是mRNA?再答:转进去的是DNA。整合到受体基因,表达mRNA再问:那你研究某一基因时,若需克隆你是不是一般以DNA序列设计引物啊?若是以mR
用primerpremie
反转录的差异显示PCR不同于DNA直接进行PCR.首先,我们需要扩增的是DNA,反转录酶是必须的.楼主应该知道,DNA的PCR不像体内DNA合成那样,体内合成需要RNA引物,而体外是不需要RNA引物,
因为RNA不稳定,非常容易降解.生活实验中随处可见RNA酶,比如你皮肤上、呼一口气里面,都可能有,可以降解RNA.而且DNA聚合酶它主要是要一个3‘的磷酸基团,所以DNA和RNA都一样.而且RNA掺入
Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC.看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所
是从NCBI里面的序列库中搜索的,自动搜索符合筛选条件的序列,从而给出引物序列blast是要求NCBI里面有的序列才能验证.你研究的物种基因组测序结果发布了吗?如果发布了的话就不用担心序列不全了
是编码链.用错链对引物设计有影响,因为核苷酸结构不对称,分三端和五端.所以5'-ATCGXXXXXXXXXXXXXX和3‘-ATCGXXXXXXXXXXXXXX是两个不同的引物分子.引物设计软件都使用
首先查道你的基因序列(NCBI搜),第二查引物设计原则,第三下载个引物设计软件设计,简单好用的有primerpremier5.0,这些都能在网上搜到,软件用法也能搜到.
查到的是cDNA,直接粘贴就可以.
直接设计只要包含了整个CDS区就可以再问:哦,那CDS和ORF是一样的吗,怎么查找基因的CDS区啊再答:恩差不多回事ORF是DNA上的CDS是mRNA上的看你模板用的是基因组DNA还是cDNA了反正就
引物是一个RNA片段,叫RNAprimer.然后以它为起点开始复制.
引物长度不重要.其实,最重要的是引物与目标序列完全匹配就可以了.明显的发夹结构及引物自身和引物相互间的连接键能要注意一下,其他都没有什么.多试试,楼主一定能成功的.以下是我认为比较重要的地方,1、引物
引物设计与编码链与模板链都没有关系,根据你讲的后期表达,说明需要表达出这种蛋白,那么你的PCR应该是以这段基因的mRNA为模板来设计引物,这样才是外显子所需要表达翻译的蛋白.生物都是基因转录mRNA为
应该是对的.因为G或C能互补配对形成3个氢键,所以结合会更加牢固.