已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
来源:学生作业帮 编辑:百度作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/06/25 18:38:00
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
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首先请上NCBI BLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.
若搜索不到任何信息,就需要通过设计兼并引物.比如你的蛋白质N端序列为
MTAGSR...
上游引物即为5'-ATG NNN NNN ...-3'(参考那个密码子表,和兼并碱基的标法,吾手头没有,记不住额)
下游引物就得反过来,假设蛋白序列为 N-XX-C 其编码DNA为 5'-GAN GAN-3'
则下引物为 5'-NTC NTC-3'
若搜索不到任何信息,就需要通过设计兼并引物.比如你的蛋白质N端序列为
MTAGSR...
上游引物即为5'-ATG NNN NNN ...-3'(参考那个密码子表,和兼并碱基的标法,吾手头没有,记不住额)
下游引物就得反过来,假设蛋白序列为 N-XX-C 其编码DNA为 5'-GAN GAN-3'
则下引物为 5'-NTC NTC-3'
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?从5'端or3‘端
各位高手请问一下Burkholderia菌是属于细菌,我可以用3'RACE方法扩增其全基因序列吗?引物怎么设计
如果要使用PCR扩增一段已知的DNA序列,要如何设计引物
根据某一基因mRNA序列设计的引物,可以用来从个体提取全基因组中DNA中扩增该基因么?
引物设计问题,以mRNA序列设计引物,然后用cDNA为模板来扩增,在设计引物时mRNA序列是否要反转序列?
已知到某一基因的部分序列想要设计引物继续扩序列,选取哪一块设计引物
scleraxis的基因序列 设计引物
如何通过已知的引物序列查询基因的全序列
怎样通过已知基因序列和引物序列 测算PCR产物大小
若给一指定DNA序列并需要通过PCR扩增此序列,如何设计扩增引物?
我提取RNA,反转录得到cDNA,我要由此扩增功能基因,请问引物设计时,用查到的mRNA序列,还是用cDNA序列